归属不同、馆藏不同。

1、国家博物馆是中央文化管理部门直接管理的全国性博物馆，由国家文物局直接领导，是国家级博物馆的代表，其馆藏主要是以中国历史文化为主，包括大量的国宝级文物。而首都博物馆则是由北京市文化局管理的地方性博物馆，其馆藏主要是以北京历史文化为主，包括大量的北京特色文物。

2、国家博物馆作为全国性博物馆，其展览和文化交流的影响力和范围都要比首都博物馆更广泛。国家博物馆还有更严格的管理和保护措施，包括展览设计、文物保护等方面。而首都博物馆则更加注重本地文化的传承和推广，也更加贴近市民生活和文化需求。

首都博物馆和国家博物馆的区别在于级别和面积。

首都博物馆是集收藏、展览、研究、考古、公共教育、文化交流于一体的博物馆，是北京地区大型综合性博物馆，属中国省市级综合性博物馆。国家博物馆是历史与艺术并重，集收藏、展览、研究、考古、公共教育、文化交流于一体的综合性博物馆，隶属于文化部。

首都博物馆位于复兴门外大街16号，国家博物馆位于北京市中心天安门广场东侧，东长安街南侧，与人民大会堂东西相对称。国家博物馆是世界上建筑面积最大的博物馆，总建筑面积近20万平方米。总用地面积7万平方米。建筑高度42.5米，地上5层，地下2层。

首都博物馆和国家博物馆哪个比较出色呢？

从文物级别来讲，国博有好多厉害的文物，好多都是禁止出境展览的，首博这类文物也有，但是少，而且没被国博调拨过去展览就不错了。从展览主线来说，国博讲述的是中国历史上整个国家的方方面面，譬如说古代中国可以看到中国的历史脉络。

首博的展览主线就是北京地区的历史，以及在北京地区出土的青铜、玉器、佛造像等。国博因为讲的是中国的故事，每一个历史时期的每一个点都会从地方要来一两件有标志性的，当然，有的能要的来，有的要不来，有点广撒网潜挖坑的感觉。

以上内容参考百度百科-首都博物馆百度百科-国家博物馆